Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Prop1P97458 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Prop1P97458 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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