Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cbx1P83917 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cbx1P83917 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms