Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms