Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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