Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx2P81066 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms