Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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