Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr1bP70700 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms