Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NficP70255 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NficP70255 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms