Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps3P62908 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms