Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ube2nP61089 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2nP61089 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms