Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp5bP56480 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms