Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PctpP53808 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PctpP53808 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PctpP53808 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PctpP53808 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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