Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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