Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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