Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms