Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ptx3P48759 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms