Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms