Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LtbP41155 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms