Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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TtlP38585 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtlP38585 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TtlP38585 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtlP38585 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms