Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TpoP35419 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TpoP35419 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TpoP35419 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TpoP35419 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TpoP35419 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TpoP35419 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms