Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcdP28867 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcdP28867 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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