Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgaP26339 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ChgaP26339 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ChgaP26339 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms