Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms