Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PparaP23204 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PparaP23204 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PparaP23204 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PparaP23204 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PparaP23204 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PparaP23204 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PparaP23204 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PparaP23204 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PparaP23204 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PparaP23204 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms