Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms