Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PdgfaP20033 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfaP20033 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms