Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms