Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NefhP19246 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NefhP19246 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NefhP19246 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NefhP19246 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NefhP19246 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NefhP19246 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms