Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Csn1s1P19228 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csn1s1P19228 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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