Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18530 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18530 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms