Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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P18528 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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P18528 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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P18528 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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P18528 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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P18528 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18528 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P18528 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18528 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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