Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms