Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx1P13297 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx1P13297 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Msx1P13297 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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