Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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