Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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