Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PomcP01193 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PomcP01193 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PomcP01193 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PomcP01193 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PomcP01193 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PomcP01193 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PomcP01193 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PomcP01193 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PomcP01193 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PomcP01193 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PomcP01193 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms