Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ptpn20O55082 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms