Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Copb2O55029 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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Copb2O55029 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Copb2O55029 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Copb2O55029 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Copb2O55029 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Copb2O55029 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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