Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Timm44O35857 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Timm44O35857 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Timm44O35857 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Timm44O35857 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Timm44O35857 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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