Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kpna3O35344 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kpna3O35344 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms