Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms