Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cnih2O35089 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cnih2O35089 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cnih2O35089 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cnih2O35089 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih2O35089 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms