Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2-Q1O19441 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Q1O19441 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms