Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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