Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms