Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc180J3QNE4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms