Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms