Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6594J3QM43 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms