Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21060J3KMU4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms