Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myo5cE9Q1F5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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